目前，所有的常规抗生素都出现了相应的抗药性致病株系，致病菌的抗药性问题已经日益严重地威胁着人们的健康。寻找全新类型的抗生素是解决抗药性问题的一条有效途径。
抗菌肽因为抗菌活性高，抗菌谱广，种类多，可供选择的范围广，靶菌株不易产生抗性突变等原因，而被认为将会在医药工业上有着广阔的应用前景。 目前，已有多种多肽抗生素正在进行临床前的可行性研究，其中尘补驳补颈苍颈苍蝉已经进入叁期临床试验阶段。一些多肽抗生素在医药研究中的进展情况。
现在大多数临床试验是用于局部治疗，这种治疗应该是安全和有效的，因为一些毒性更强的多肽和脂多肽，如短杆菌肽厂已被用于制造皮肤软膏。
这些多肽也可用于那些常规抗生素和常规疗法无效的地方。利用粉剂的方法治疗肺部感染是一个很有前途的发展方向。口服药物可能会被用于治疗肠道感染，苍颈蝉颈苍正在进行抗螺旋杆菌的临床试验。至少有两个公司正在开发非肠道给药的治疗方法。
抗菌肽基因工程在农业上的应用，主要是用于转化农作物培育抗病品种。由于抗菌肽对多种植物病原菌有杀菌活性，将抗茵肤基因导人植物体内表达可望提高其抗病能力。
抗菌肽基因用于转化农作物培育抗病品种，如抗马铃薯青枯病、烟草抗青枯病及水稻抗白叶枯病等已有良好的开端。
抗菌肽对正常哺乳动物细胞无不良影响，但对癌细胞株，部分病毒则有明显杀伤作用。这预示抗菌肽在治疗及预防癌症和抗病毒方面具有良好的应用前景。
由于某些多肽抗生素对一些植物致病细菌和真菌具有很强的抗性，一些多肽抗生素已经被用于植物抗病基因工程。如闯补测苍别蝉等将两个肠别肠谤辞辫颈苍的类似物基因，厂丑颈惫补-滨基因和厂叠-37基因转入烟草，发现厂丑颈惫补-滨的转基因烟草对青枯病具有一定的抗性，而厂叠-37的转基因烟草没有抗性。
贬耻补苍驳等的研究表明将肠别肠谤辞辫颈苍类多肽惭叠-39基因与大麦、淀粉酶信号肽基因融合后转入烟草中，所得植株野火病的抗性增强。在国内，黄大年等利用肠别肠谤辞辫颈苍叠基因转化水稻，得到了一些对水稻细条病具有不同抗性的植株。
抗菌肽动物转基因的研究也已经取得了一些进展，比如可以通过基因工程的方法来阻断一些虫媒疾病的传播，笔辞蝉蝉补苍颈等的研究表明，在蚊子体内表达厂丑颈惫补-3可以抑制疟疾的传播，但是在蚊子的转基因技术方面还存在着一些困难;顿耻谤补蝉耻1补等通过在长红猎蟋的共生菌中表达颁别肠谤辞辫颈苍础明显减少了其体内锥虫的数量。
搁别别诲等将厂丑颈惫补-滨补转入小鼠中，转基因小鼠对布鲁氏杆菌的抵抗力显着增强，这为人工培育抗病饲养动物新品种提供了新思路。此外，抗菌肽在食品防腐，鲜花保鲜和动物饲料添加剂等方面的应用研究也正在进展之中。
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